Reklam
Teknoloji Haberleri

Araştırmacılar COVID-19 Virüsünün “İnsanlara Son Derece Uyarlanmış” Olduğunu Buluyor – Kesin Kökenleri Hala Bir Gizem

reklam
Reklam


Virüs Analizi Laboratuvarı Konsepti

COVID-19 pandemisine neden olan virüs olan SARS-CoV-2’yi incelemek için bilgisayar modellemesi kullanan bilim adamları, virüsün yarasa veya pangolin hücrelerinden ziyade insan hücrelerini enfekte etmek için en ideal şekilde uyarlandığını keşfettiler ve yine kökenine ilişkin soruları gündeme getirdiler.

reklam

Nature dergisinde yayınlanan bir makalede Bilimsel RaporlarAvustralyalı bilim adamları, pandeminin başlangıcında SARS-CoV-2 virüsünün formunun yüksek performanslı bilgisayar modellemesini, insanlara ve 12 evcil ve egzotik hayvana bulaşma yeteneğini tahmin etmek için nasıl kullandıklarını anlatıyor.

“İnsanlar, virüse karşı yüksek duyarlılıkla tutarlı olarak en güçlü spike bağlanmasını gösterdi, ancak insanlarda enfeksiyonun ilk kaynağının bir hayvan olması çok şaşırtıcıydı.” – Profesör David Winkler, La Trobe Üniversitesi

reklam

Çalışmaları, bir yarasa virüsünün insanlara bulaşmasında rol oynamış olabilecek herhangi bir ara hayvan vektörünü tanımlamaya yardımcı olmayı ve kedi ve köpek gibi evcil hayvanların ve inek, koyun gibi ticari hayvanların duyarlılıklarının yarattığı herhangi bir riski anlamayı amaçladı. domuzlar ve atlar.

Flinders Üniversitesi ve La Trobe Üniversitesi’nden bilim adamları, her tür için önemli ACE2 protein reseptörlerinin bilgisayar modellerini özenle oluşturmak için 12 hayvan türünden genomik verileri kullandılar. Bu modeller daha sonra SARS-CoV-2 başak proteininin her türün ACE2 reseptörüne bağlanma gücünü hesaplamak için kullanıldı.

Şaşırtıcı bir şekilde sonuçlar, SARS-CoV-2’nin insan hücrelerinde ACE2’ye yarasalar ve pangolinler dahil olmak üzere test edilen hayvan türlerinin herhangi birinden daha sıkı bağlandığını gösterdi. Test edilen hayvan türlerinden biri orijin ise, normalde virüse en yüksek bağlanmayı göstermesi beklenir.

Nikolay Petrovski

Flinders Üniversitesi’nden Profesör Nikolai Petrovsky. Kredi bilgileri: Flinders Üniversitesi

La Trobe Üniversitesi Profesörü David Winkler, “İnsanlar, virüse karşı yüksek duyarlılıkla tutarlı olarak, en güçlü spike bağlanmasını gösterdi, ancak bir hayvanın insanlarda enfeksiyonun ilk kaynağı olması çok şaşırtıcı” diyor.

Başlangıçta ArXiv önbaskı sunucusunda yayınlanan bulgular, şimdi hakemli incelemeye tabi tutulmuş ve şu anda yayınlanmıştır. Bilimsel Raporlar (Bahar Doğa).

“Bilgisayar modellemesi, virüsün yarasa ACE2 proteinine bağlanma yeteneğinin, insan hücrelerini bağlama yeteneğine göre zayıf olduğunu buldu. Bu, virüsün doğrudan yarasalardan insanlara bulaşmasına karşı çıkıyor. Dolayısıyla virüsün doğal bir kaynağı varsa, insanlara ancak henüz bulunamayan bir ara tür aracılığıyla gelmiş olabilir” diyor Flinders üyesi Profesör Nikolai Petrovsky.

David Winkler

Profesör David Winkler, La Trobe Üniversitesi, Avustralya. Kredi bilgileri: La Trobe Üniversitesi

Ekibin bilgisayar modellemesi, SARS-CoV-2 virüsünün ayrıca, Güneydoğu Asya’nın bazı bölgelerinde bulunan ve nadiren gıda veya geleneksel ilaç olarak kullanım örnekleri olan nadir bir egzotik karıncayiyen olan pangolinlerden ACE2’ye nispeten güçlü bir şekilde bağlandığını gösteriyor. Profesör Winkler, pangolinlerin, çalışmanın baktığı tüm hayvanlar arasında en yüksek başak bağlama enerjisi gösterdiğini söylüyor – yarasalardan, maymunlardan ve yılanlardan önemli ölçüde daha yüksek.

Pangolinlerde SARS-CoV-2 buldukları bazı bilim insanları tarafından pandeminin başlarında yanlış bir şekilde öne sürülmüş olsa da, bunun nedeni bir yanlış anlaşılmaydı ve tanımladıkları pangolin koronavirüsünün %90’dan az genetik benzerliğe sahip olması nedeniyle bu iddia hızla geri çekildi. Profesör Petrovsky, SARS-CoV-2’nin atası olamayacağını söylüyor.

Ancak bu çalışma ve diğerleri, pangolin koronavirüs spike proteininin ACE2’yi bağlayan spesifik bölümünün, SARS-CoV-2 spike proteinininkiyle neredeyse aynı olduğunu göstermiştir.

“Neredeyse aynı başak proteininin bu paylaşımı, SARS-CoV-2’nin pangolin ACE2’ye neden bu kadar iyi bağlandığını neredeyse kesin olarak açıklıyor. Profesör Petrovsky, Pangolin ve SARS-CoV-2 spike proteinleri, yakınsak bir evrim süreci, virüsler arasındaki genetik rekombinasyon veya genetik mühendisliği yoluyla, bu olasılıkları ayırt etmenin mevcut bir yolu olmaksızın benzerlikler geliştirmiş olabilir, “diyor Profesör Petrovsky.

“Genel olarak, ilginç pangolin ACE2 sonuçlarını bir kenara bırakırsak, çalışmamız COVID-19 virüsünün insanları enfekte etmek için çok iyi adapte olduğunu gösterdi.”

Profesör Winkler, “Ayrıca, kediler, köpekler ve inekler gibi bazı evcil hayvanların da SARS-CoV-2 enfeksiyonuna duyarlı olma ihtimalinin yüksek olduğu sonucuna vardık” diye ekliyor.

Virüsün insanlara nasıl bulaştığına dair son derece önemli ve açık sorunun şu anda iki ana açıklaması var. Virüs, henüz bulunamayan (zoonotik kökenli) bir aracı hayvan aracılığıyla yarasalardan insanlara geçmiş olabilir, ancak bir viroloji laboratuvarından kazara salındığı henüz göz ardı edilemez. Bu açıklamalardan hangisinin doğru olduğunu belirlemek için kapsamlı bir bilimsel, kanıta dayalı araştırma gereklidir.

Araştırmacılar, bu kadar etkili bir insan patojeni haline gelmek için adapte edilen SARS-CoV-2 virüsünün nasıl ve nerede bir sır olarak kaldığı sonucuna vararak, hastalığın kökenlerini bulmanın insanlığı gelecekteki koronavirüs pandemilerine karşı koruma çabalarına yardımcı olacağını da sözlerine ekledi.

Referans: Sakshi Piplani, Puneet Kumar Singh, David A. Winkler ve Nikolai Petrovsky, 24 Haziran 2021, “SARS-CoV-2 spike protein-ACE2 bağlanma afinitelerinin türler arasında in silico karşılaştırması ve virüs orijini için çıkarımlar”, Bilimsel Raporlar.
DOI: 10.1038 / s41598-021-92388-5




scitechdaily.com

Source link

reklam
reklamm

Bir cevap yazın

E-posta hesabınız yayımlanmayacak. Gerekli alanlar * ile işaretlenmişlerdir

reklam
Başa dön tuşu

Reklam Engelleyici Algılandı

Lütfen Reklam Engelleyiciyi Kapatınız